Last Updated on 2026年3月16日 by 渋田貴正

株式投資をしている方の多くは、証券会社の「特定口座(源泉徴収あり)」を利用しています。この口座を利用している場合、株の利益や配当は証券会社が税金を計算して源泉徴収するため、原則として確定申告は不要です。これを「申告不要制度」といいます。ところが近年導入された「ミニマムタックス税制(特定基準所得金額課税)」では、この申告不要制度にもかかわらず金額を確認しなければならない場面があります。」

通常は申告しなくてもよい特定口座の取引でも、ミニマムタックス税制の判定や、税務署への申告のために年間取引報告書が必要になるケースがあるからです。税ここでは、ミニマムタックス税制と特定口座、そして年間取引報告書の扱いを実務目線で整理します。

ミニマムタックス税制とは何か

ミニマムタックス税制とは、非常に高い所得がある人について、控除や特例を利用して税負担が極端に低くなることを防ぐための制度です。正式名称は「特定基準所得金額課税」といいます。簡単に言うと、一定以上の所得がある場合には、通常の所得税計算とは別の計算方法で最低限の税負担を確認する仕組みです。
この制度のポイントは、「確定申告書に書かれている所得だけでは判断しない」という点です。制度の趣旨は、全体としてどの程度の所得があるのかを把握することにあります。そのため、申告不要制度の所得であっても、ミニマムタックス税制の適用や税額計算の確認のためにすべての特定口座の金額を確認する必要があります。

まず基本を確認しておきます。証券会社の特定口座(源泉徴収あり)では、株式の譲渡益や配当について次の仕組みが採用されています。

項目 内容
税金計算 証券会社が自動計算
税率 20.315%(所得税+住民税)
確定申告 原則不要

つまり、証券会社が税金を徴収しているため、その取引だけで課税関係は完結します。そのため確定申告書には出てこないことが多く、投資家自身も「税務とは無関係」と思ってしまいがちです。

複数の特定口座は一部だけ確定申告することもできる

さらに実務では、証券口座を複数持っている方も少なくありません。例えば楽天証券とSBI証券の両方を利用しているケースです。この場合、特定口座(源泉徴収あり)は口座単位で申告するかどうかを選択できます。例えば次のようなケースです。

証券会社 損益 申告
楽天証券 利益100万円 申告する
SBI証券 利益50万円 申告しない

このように、楽天だけ申告してSBIは申告不要にする、といった扱いは制度上認められています。ただし同一証券会社の口座内では、一部の銘柄だけ申告するということはできません。口座単位でまとめて扱う必要があります。

ミニマムタックス税制では申告しない特定口座の書類も税務署に提出必要

ところが、ミニマムタックス税制ではこの考え方が少し変わります。制度の目的は「高額所得者の税負担の最低ラインを確認すること」です。つまり、通常は確定申告に出てこない所得でも、制度の判定では把握しておく必要があります。ミニマムタックス税制の判定上は、「申告書に書いていないから存在しない」という扱いにはならないのです。

ここで登場するのが「年間取引報告書」です。これは証券会社が毎年作成する書類で、その年の株式取引や配当の内容がまとめられています。
特定口座では申告不要制度があるため、通常は税務署に提出する必要はありません。しかしミニマムタックスの判定や説明を行う場合、税務署側は所得の全体像を確認する必要があります。その際に最も確実な資料が年間取引報告書です。
つまり実務では次のような対応になります。

書類 通常の申告 ミニマムタックス税制に該当する場合
年間取引報告書 提出不要 確認資料として取得
配当計算書 提出不要 参考資料として確認

制度の趣旨から考えると、「申告不要だから見なくてよい」という扱いにはなりません。むしろ高額所得者の場合は、資産運用も含めた所得状況を説明できるようにしておく必要があります。

結果としてミニマムタック税制対象なる可能性高い場合は、特定口座取引すべて整理し、確定申告反映おく実務かえってシンプルなることあります。特定口座申告不要制度あるため申告しないこと可能ですが、制度判定では所得全体確認する必要あります。そのため、最初から年間取引報告書申告反映おいが、から説明資料提出するより手間なくなる場合あるです。

例えば次のようなケースがあります。
会社経営者の方で、役員報酬や不動産所得などでかなり高額の所得があります。一方で資産運用として複数の証券会社を利用しており、すべて特定口座(源泉徴収あり)で取引しています。本人としては「株の利益は申告していないから税務とは関係ない」と思っているケースです。
しかしミニマムタックスの判定を行う際には、複数の特定口座の年間取引報告書をすべて確認することになります。申告書に載っていない所得でも、説明できる状態にしておくことが重要だからです。

ミニマムタックス税制が導入されたことで、高額所得者の税務管理はこれまでより少し丁寧さが求められるようになりました。特定口座の取引は申告不要制度があるため軽視されがちですが、制度判定や説明のためには重要な資料になることがあります。
特に証券口座を複数持っている場合は、すべての年間取引報告書を整理しておくことが大切です。申告書に載せるかどうかとは別に、「税務上説明できる状態」を作っておく必要があります。
ミニマムタックス税制や資産所得の扱いは、制度の理解と書類管理が非常に重要です。当事務所では税理士と司法書士の立場から、税務だけでなく資産管理や制度対応も含めてサポートしております。特定口座や資産所得の扱いで不安がある方は、どうぞお気軽にご相談ください。